1、微生物饲料添加剂所用菌种

　　微生物饲料添加剂的首要问题就是选择适当的菌种。由于许多菌都具有宿主特异性，与宿主形成供体与受体的关系，因此微生物饲料添加剂的菌种最好从本动物的消化道中分离，以利于添加剂中的细菌在宿主体内定植。其次，选择菌种的繁殖率要高，这样才能迅速占据消化道，并且细菌能在酸性环境中有很强的生存能力。再次，所选菌种要有较强的产酸能力，以利于消化道营养物的消化吸收。只有这样，才能提高饲料的利用率。

　　根据美国Alltech生物技术中心规定，用作饲料添加剂的细菌对胆酸应有70%以上的抵抗力。美国食品及药物管理局1989年公布的可用作饲料添加剂且对人畜均无副作用的微生物：黑曲霉、米曲霉、凝结芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌（仅用非抗生素生产菌株）、嗜淀粉拟杆菌、多毛拟杆菌、凄瘤胃拟杆菌、产琥珀酸拟杆菌、青春双歧杆菌、动物双歧杆菌、两岐双岐杆菌、婴儿双岐杆菌、长双岐杆菌、嗜热双岐杆菌、嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌、纤维二糖乳杆菌、弯曲乳杆菌、德氏乳杆菌、乳酸乳杆菌、植物乳杆菌、肠膜状明串珠菌、乳酸片球菌、啤酒片球菌、戊糖片球菌、费氏丙酸杆菌、谢氏丙酸杆菌、酿酒酵母、乳脂链球菌、乳链球菌二丁酮乳新亚种、粪链球菌、乳链球菌、嗜热链球菌等。

　　2、微生物饲料添加剂的作用机理

　　微生物饲料添加剂的作用机理目前尚未完全明白，但根据在养殖业的应用综合作用的结果有以下几个方面。

　　2.1 平衡消化道内微生物数量

　　各种家畜、家禽健康的肠道内生长着各种各样的微生物种群，它们之间相互依存、相互制约，构成消化道内微生物平衡状态。在这个微生态系统中，优势种群对整个菌群起决定作用，优势种群一但失去作用，则微生态失衡。使用微生物添加剂可以通过外源性补充有益菌种，维持有益微生物的数量，保持菌群正常。饲喂饲用微生态添加剂，有益的微生物到达肠道后迅速繁殖，在数量上占绝对优势，在繁殖过程中消耗大量氧，造成不利有害菌生存繁殖环境（因有害菌大多为需氧菌），同时还可通过产生抗菌物质（如有机酸等）降低pH值，以及与有害菌竞争养分或附着部位抑制其它病源微生物生长，从而保持或恢复肠道内微生物群落的平衡，达到防病促生长作用。

　　2.2 调节补充各种家畜、家禽营养成分

　　有益微生物在家畜、家禽消化道内生存繁殖过程中能代谢产生多种酶、氨基酸、维生素（如维生素K、C、B1、B2等），如酵母菌和芽孢杆菌能产生脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶，直接分解、消化饲料营养成分。有的微生物能产生分解复杂糖类的酶或植酸梅，改善消化道食糜的物理特性或消除日粮中的抗营养因子，直接提高饲料的转化率，促进动物的生长和生产。

　　2.3 防止产生有害物质，保护饲养环境

　　饲用微生物添加剂在家畜、家禽的消化道内能促使营养物质的消化吸收，因而可减少氨和胺的产生，并且可以减少肠道内容物、粪便、门静脉中的氨含量及肠内甲酚、吲哚的含量，降低粪便臭味，净化畜禽舍环境。此外还可以在肠道内生长形成致密性膜菌群，形成生物屏障，阻止有害物质的吸收。

　　2.4 提高机体免疫力，产生非特异性免疫调节因子

　　微生物饲料添加剂在动物体内可提高动物体内抗体水平，或提高巨噬细胞的活性，增强机体免疫功能，及时杀灭侵入体内至病菌，从而防止疾病的发生。